যেখানে যমুনা সেতুতে এক বছরেই টোল আদায় হয়েছে নির্মাণ ব্যয়ের এক-পঞ্চমাংশ, পদ্মা সেতু থেকে নির্মাণ ব্যয় উঠবে ৩৫ বছরে এবং হানিফ ফ্লাইওভার থেকে উঠবে ২৪ বছরে; সেখানে কর্ণফুলী টানেল থেকে টোল আদায় করে নির্মাণ ব্যয় তুলতে লাগবে ২৬৫ বছর। প্রাপ্ত তথ্যানুযায়ী, প্রত্যাশিত যানবাহন না পাওয়া এবং আশপাশের অঞ্চলগুলোতে সম্ভাব্য শিল্পায়নে গতি না থাকায় আর্থিক ঝুঁকি বাড়াচ্ছে কর্ণফুলী টানেল। এই টানেল নির্মাণে ব্যয় করা হয়েছে প্রায় ১০ হাজার ৬৮৯ কোটি টাকা। অথচ বর্তমান টোল আদায়ের হার দিয়ে এই নির্মাণ ব্যয় তুলতে সময় লাগবে প্রায় ২৬৫ বছর। যদিও সম্প্রতি লোকসানের পরিমাণ কিছুটা কমে এসেছে। এখন প্রতি মাসে অন্তত ১০ লাখ টাকা লোকসান গুনছে এই মেগা প্রকল্প।নির্মাণের সময় সমীক্ষায় বলা হয়েছিল, প্রতিদিন ২৮ হাজারের বেশি যানবাহন চলাচল করবে এই টানেল দিয়ে। অথচ বর্তমানে দৈনিক মাত্র ৪ হাজার যানবাহন চলাচল করছে, যা লক্ষ্যমাত্রার মাত্র ১৪ শতাংশ। এসব গাড়ি থেকে টোল বাবদ আদায় করা অর্থ দিয়ে টানেলটি রক্ষণাবেক্ষণ করাও অসম্ভব হয়ে পড়েছে। ফলে প্রকল্পটি সরকারের আর্থিক ঝুঁকি বাড়াচ্ছে। পরিকল্পনা কমিশনের বাস্তবায়ন পরিবীক্ষণ ও মূল্যায়ন বিভাগের প্রভাব মূল্যায়ন শীর্ষক এক প্রতিবেদনে এই ঝুঁকির কথা বলা হয়েছে।